Der Galenus-von-Pergamon-Preis ist unterteilt in einen Preis für Grundlagenforschung sowie zwei Preise für Arzneimittelinnovationen.

In Form einer Medaille und 10.000 Euro wird eine herausragende Forschungsleistung in der klinischen und/oder experimentellen Pharmakologie gewürdigt, die außerhalb der pharmazeutischen Industrie erbracht wurde.

In Form einer Medaille wird mit dem Preis für Arzneimittelinnovationen in den zwei Kategorien „Primary Care“ und „Specialist Care“ je ein herausragendes, zum Zeitpunkt der Einreichung bereits ein Jahr in Deutschland zugelassenes und in den Verkehr gebrachtes Arzneimittel gewürdigt.